Escala molecularMolecular scale
Las proteínas se muevenProteins move
Con dinámica molecular sigo cómo los residuos de una proteína forman y rompen interacciones en el tiempo. De ahí nació RIP-MD, y con docking explicamos por qué un mismo fármaco reconoce receptores muy distintos.With molecular dynamics I follow how a protein's residues make and break interactions over time. That is where RIP-MD came from, and docking helped us explain why one drug recognizes very different receptors.
Escala genómicaGenomic scale
El mismo ADN, leído distintoThe same DNA, read differently
Cada célula enciende regiones distintas de su genoma. Integro accesibilidad de la cromatina, marcas de histonas como H3K27ac y unión de factores de transcripción para saber qué está activo y cuándo.Each cell switches on different regions of its genome. I integrate chromatin accessibility, histone marks such as H3K27ac and transcription factor binding to learn what is active, and when.
Escala regulatoriaRegulatory scale
Buscar a los reguladores maestrosFinding the master regulators
Conecto factores de transcripción con los genes que controlan y busco a los pocos que mueven al resto: en linfocitos T del intestino inflamado, en Huntington, en embriones, en bacterias y en tomate.I connect transcription factors to the genes they control and look for the few that move everything else: in T cells of the inflamed gut, in Huntington's disease, in embryos, in bacteria and in tomato.
Escala celular y clínicaCellular and clinical scale
Del tejido a cada célulaFrom tissue to every cell
Separo los tipos celulares de un tumor o de un cerebro con datos de célula única, y combino transcriptómica, histopatología y aprendizaje automático para anticipar la metástasis.I resolve the cell types of a tumor or a brain with single-cell data, and combine transcriptomics, histopathology and machine learning to anticipate metastasis.